CustomAutoAnnotationDialog Plasmid Auto Annotations Поиск плазмид Selected features Выбранные аннотации Promoter Promoter Origin Origin Terminator Terminator Primer Primer Gene Gene Other features Другие аннотации Regulatory Regulatory FindAnnotationCollocationsDialog 1 1 2 2 Region size: Размер региона: Find Groups of Annotated Regions Поиск сгруппированных аннотаций Save regions as annotations Сохранить регионы как аннотации Clear results Сбросить результаты Result strand Расположение результатов Direct Прямая Complement Комплементарная Both Обе Annotation must fit into region Аннотация должна содержаться в регионе U2::AnnotatorPlugin DNA Annotator Поиск сгруппированных аннотаций This plugin contains routines to manipulate and search DNA sequence annotations Поиск сгруппированных аннотаций U2::AnnotatorViewContext Find annotated regions... Поиск участков, соответствующих аннотации... Annotate plasmid... Автоматический поиск плазмид... Warning Предупреждение No annotations found Аннотаций не найдено U2::CollocationSearchTask Search for annotated regions Поиск сгруппированных аннотаций U2::CollocationsDialogController Search Поиск Cancel Отмена <<click '+' button to add new annotation>> << Кликните '+' чтобы добавить аннотацию >> Stop Остановить Searching... found %1 regions. Progress: %2% Сканируется последовательность, прогресс %2. Найдено %1 регионов Found %1 regions Найдено %1 регионов Ready Готов к поиску Select annotation names to search Выберите аннотации No annotations left Аннотаций больше нет U2::CustomAutoAnnotationDialog Annotate Аннотировать U2::CustomPatternAnnotationTask Custom pattern annotation Пользовательская аннотация U2::CustomPatternAutoAnnotationUpdater Plasmid features Аннотирование плазмид U2::GeneByGeneReportTask Generating gene-by-gene approach report Generating gene-by-gene approach report U2::LocalWorkflow::CollocationPrompter sequence from %1 последовательности из %1 set of annotations from %1 набора аннотаций из %1 For each %1 and %2, Для каждых %1 и %2, For each %1%2, Для каждого %1%2, Annotations themselves may not span beyond the region. целиком. %1 look if %2 annotations appear collocated within same region of length %3.%4 Output the list of found regions annotated as %5. %1 искать группы аннотаций %2 расположенные %4 внутри регионов не длиннее %3. Выдать список найденных групп в виде аннотаций "%5". U2::LocalWorkflow::CollocationWorker Group annotations Найденные регионы Create new annotations Создать новые аннотации Result annotation Имя аннотации Name of the result annotations to mark found collocations. Имя результирующих аннотаций отмечающих найденные группы. Group of annotations Аннотации в группе Region size Размер региона Effectively this is the maximum allowed distance between the interesting annotations in a group. Фактически, это максимальная допустимая дистанция между аннотациями в одной группе. Must fit into region Компактные группы Whether the interesting annotations should entirely fit into the specified region to form a group. Аннотации в группе должны целиком входить в указанный регион - т.е. дистанция в группе считается по внешним границам аннотаций. Result type Тип аннотации Copy original annotations or annotate found regions with new ones. Копировать оригинальные аннотации или аннотировать найденные регионы новыми. Include boundaries Включить границы Include most left and most right boundary annotations regions into result or exclude them. Включить границы региона в аннотацию или исключить их. Collocation Search Поиск групп аннотаций Copy original annotations Копировать исходные аннотации At least 2 annotations are required for collocation search. Необходимо указать не менее 2-х различных имён аннотаций для поиска. Annotated regions containing found collocations. Список аннотаций отмечающих найденные группы аннотаций. A list of annotation names to search. Found regions will contain all the named annotations. Список имён интересующих аннотаций в группе. Ищутся регионы содержащие все указанные аннотации. Finds groups of specified annotations in each supplied set of annotations, stores found regions as annotations. Поиск сгруппированных аннотаций. Ищутся регионы последовательности, содержащие все аннотации из заданного списка, расположенные друг от друга на расстоянии не более заданного. Input data Входные данные An input sequence and a set of annotations to search in. Входные последовательность и набор аннотированных регионов для поиска. U2::LocalWorkflow::GeneByGeneReportPrompter unset не указан For annotated genes from %1 build gene-by-gene approach report. Для аннотированных генов из %1 построить приближенный отчет по каждому гену. With sequence identity of %1. С идентичностью последовательности %1. Using %1 to compare gene and genome sequences. Использовать %1 для сравнения гена и геномных последовательностей. Output result table to %1. Выходная таблица в %1. If a report file already exists, %1 it Если файл уже существует, %1 его U2::LocalWorkflow::GeneByGeneReportWorker Input annotations Входные аннотации Gene annotations. Аннотации гена. Input sequences Входные последовательности Gene sequences. Последовательности гена. Gene by gene report data. Отчетные данные. Gene with similar regions to for report. Ген со схожими регионами для отчета. Output file Выходной файл File to store a report. Файл для сохранения отчета. Annotation name Имя аннотации Annotation name used to compare genes and reference genomes. Имя аннотации используемое для сравнения генов и референсных геномов. Existing file Существующий файл If a target report already exists you should specify how to handle that. Merge two table in one. Overwrite or Rename existing file. Если файл уже существует выберите операцию. Соединить две таблицы в одну. Переписать или Переименовать существующий файл. Identity cutoff Сдвиг идентичности Identity between gene sequence length and annotation length in per cent. BLAST identity (if specified) is checked after. Идентичность между длиной гена и длиной аннотации в процентах. Gene-by-gene Approach Report Отчёт по каждому гену Output a table of genes found in a reference sequence. Таблица генов найденных в референсной последовательности.