PairwiseAlignmentSmithWatermanOptionsPanelMainWidget Form Форма Algorithm version: Версия алгоритма: Scoring matrix: Матрица: Gap penalty Штраф за пробел Open: Открыть: Extension: Расширение: QObject START SmithWatermanAlgorithmOPENCL::launch START SmithWatermanAlgorithmOPENCL::launch Kernel::setArg(%1) failed Kernel::setArg(%1) failed OPENCL: Running CL program OPENCL: Running CL program FINISH SmithWatermanAlgorithmOPENCL::launch FINISH SmithWatermanAlgorithmOPENCL::launch Starting cleanup OpenCL resources Starting cleanup OpenCL resources Finish cleanup OpenCL resources Finish cleanup OpenCL resources U2::GTest_SmithWatermnan ** ** , , .. .. U2::LocalWorkflow::SWPrompter unset не указан translated транслированной Searches regions in each sequence from %1 similar to all pattern(s) taken from %2. Percent similarity between a sequence and a pattern is %3. Seaches in %4 of a %5 sequence. Outputs the regions found annotated as %6. В каждой последовательности, полученной от %1 ищет регионы, похожие на паттерн(ы) %2. Совпадение между регионом последовательности и паттерном должно быть как минимум %3%. Поиск ведется в %4 %5последовательности. Возвращает найденные регионы как %6 аннотации. U2::LocalWorkflow::SWWorker Annotate as Аннотации Algorithm Алгоритм Input Data Входная последовательность Pattern Annotations Найденные аннотации The regions found. Аннотации, найденные для последовательности. Name of the result annotations. Имя аннотаций для найденных регионов. Min Score Минимальный процент совпадения Minimal percent similarity between a sequence and a pattern. Минимальный процент совпадения между регионом последовательности и паттерном. Version of the Smith-Waterman algorithm. You can use the optimized versions of the algorithm (SSE, CUDA and OpenCL) if your hardware supports these capabilities. Версия реализации алгоритма Смита-Ватермана. Если имеется соответствующее аппаратное обеспечения для ускорения вычислений могут быть использованы оптимизированные версии алгоритма (SSE, CUDA и OpenCL). Search in Translation Искать в трансляции Translates a supplied nucleotide sequence to protein and searches in the translated sequence. Указывает транслировать входную нуклеотидную последовательность в протеиновую и искать указанный паттерн в полученной протеиновой последовательности. Substitution Matrix Матрица Describes the rate at which one character in a sequence changes to other character states over time. Матрица весов для алгоритма. Filter Results Фильтрация результатов Specifies either to filter the intersected results or to return all the results. Указывает, требуется ли отфильтровывать пересекающиеся результаты. Gap Open Score Вес открытия пробела Penalty for opening a gap. Штраф, накладываемый за открытие пробела. Gap Extension Score Вес продления пробела Penalty for extending a gap. Штраф, накладываемый за продление пробела. Use Pattern Names Использовать имя паттерна Use a pattern name as an annotation name. Использовать имя паттерна в качестве имени аннотации. Qualifier name for pattern name Имя квалификатора для имени паттерна Name of qualifier in result annotations which is containing a pattern name. Имя квалификатора в аннотации, которая содержит имя паттерна. Smith-Waterman Search Поиск подстроки (алгоритм Смита-Ватермана) Searches regions in a sequence similar to a pattern sequence. Outputs a set of annotations. Under the hood is the well-known Smith-Waterman algorithm for performing local sequence alignment. Поиск подпоследовательностей, похожих на указанный паттерн, в каждой входной последовательности (нуклеотидной или протеиновой), с учётом выбранной матрицы весов. Используется реализация широко известного алгоритма Смита-Ватермана для локального выравнивания пар последовательностей. Auto Авто both strands в обеих цепях direct strand прямой цепи complementary strand комплементарной цепи Null sequence supplied to Smith-Waterman: %1 Null sequence supplied to Smith-Waterman: %1 Incorrect value: pattern alphabet doesn't match sequence alphabet Incorrect value: pattern alphabet doesn't match sequence alphabet Pattern symbols not matching to alphabet Pattern symbols not matching to alphabet Incorrect value: score value must lay between 0 and 100 Incorrect value: score value must lay between 0 and 100 Incorrect value: filter name incorrect, default value used Incorrect value: filter name incorrect, default value used Incorrect value: result name is empty, default value used Incorrect value: result name is empty, default value used Could not find complement translation for %1, searching only direct strand Could not find complement translation for %1, searching only direct strand Invalid value: weight matrix with given name not exists Invalid value: weight matrix with given name not exists Pattern Data Паттерн(ы) An input pattern sequence to search for. Входной паттерн для поиска. An input reference sequence to search in. Входная последовательность для поиска в ней. Null pattern supplied to Smith-Waterman: %1 Null pattern supplied to Smith-Waterman: %1 Can't find weight matrix name: '%1'! Can't find weight matrix name: '%1'! <empty> <empty> Wrong matrix selected. Alphabets do not match Wrong matrix selected. Alphabets do not match SmithWaterman algorithm not found: %1 SmithWaterman algorithm not found: %1 Incorrect value: search pattern, pattern is empty Incorrect value: search pattern, pattern is empty smith_waterman_task Smith waterman task Smith waterman subtasks Smith waterman subtasks Found %1 matches of pattern '%2' Found %1 matches of pattern '%2' U2::PairwiseAlignmentSmithWatermanTask Substitution matrix is empty Substitution matrix is empty Smith Waterman2 SequenceWalker Smith Waterman2 SequenceWalker Not enough memory on CUDA-enabled device. The space required is %1 bytes, but only %2 bytes are available. Device id: %3, device name: %4 Not enough memory on CUDA-enabled device. The space required is %1 bytes, but only %2 bytes are available. Device id: %3, device name: %4 The Smith-Waterman search allocates ~%1 bytes (%2 Mb) on CUDA device The Smith-Waterman search allocates ~%1 bytes (%2 Mb) on CUDA device %1 results found %1 results found U2::QDSWActor matches with at least %1 score с оценкой не менее %1 exact matches точным совпадением both strands все direct strand только прямые complement strand только комплементарные Finds pattern %1. Looks for %2 in %3. Искать паттерн %1. Искать совпадения %2 в %3. %1: percent of score out of bounds. %1: percent of score out of bounds. %1: incorrect result filter. %1: incorrect result filter. %1: pattern is empty. %1: pattern is empty. %1: can not find %2. %1: can not find %2. SSearch SSearch smith_waterman_task Поиск Смита-Ватермана Smith-Waterman Поиск Смита-Ватермана Finds regions of similarity to the specified pattern in each input sequence (nucleotide or protein one). Under the hood is the well-known Smith-Waterman algorithm for performing local sequence alignment. Поиск подпоследовательностей, похожих на указанный паттерн, в каждой входной последовательности (нуклеотидной или протеиновой), с учётом выбранной матрицы весов. Используется реализация широко известного алгоритма Смита-Ватермана для локального выравнивания пар последовательностей. Pattern Паттерн A subsequence pattern to look for. Паттерн для поиска интересующих подпоследовательностей. Min score Мин оценка The search stringency. Строгость поиска. Algorithm Алгоритм Algorithm version. Выбор версии алгоритма. Search in translation Искать в трансляции Translate a supplied nucleotide sequence to protein then search in the translated sequence. Транслировать входную нуклеотидную последовательность в протеиновую, искать указанный паттерн в последней. Scoring matrix Матрица The scoring matrix. Матрица весов для алгоритма. Filter results Фильтр результатов Result filtering strategy. Дополнительная фильтрация результатов. Gap open score Вес открытия пробела Gap open score. Вес открытия пробела. Gap ext score Вес продления пробела Gap extension score. Вес продления пробела. Auto Авто U2::SWAlgorithmADVContext Find pattern [Smith-Waterman]... Поиск подстроки (алгоритм Смита-Ватермана)... U2::SWAlgorithmPlugin Optimized Smith-Waterman Оптимизированный алгроитм Смита-Ватермана Various implementations of Smith-Waterman algorithm Различные реализации алгоритма Смита-Ватермана U2::SWAlgorithmTask Smith Waterman2 SequenceWalker Smith Waterman2 SequenceWalker Not enough memory on CUDA-enabled device. The space required is %1 bytes, but only %2 bytes are available. Device id: %3, device name: %4 Not enough memory on CUDA-enabled device. The space required is %1 bytes, but only %2 bytes are available. Device id: %3, device name: %4 The Smith-Waterman search allocates ~%1 bytes (%2 Mb) on CUDA device The Smith-Waterman search allocates ~%1 bytes (%2 Mb) on CUDA device %1 results found %1 results found