MuscleAlignmentDialog Align with MUSCLE Выравнивание с помощью MUSCLE Input and output Входные и выходные данные Input file Входной файл ... ... Output file Выходной файл Mode Конфигурация Mode details: Описание: Advanced options Дополнительные настройки Max iterations Максимальное число итераций Max time (minutes) Максимальное время работы (мин.) Translating alignment to amino allows to avoid errors of inserting gaps within codon boundaries. Трансляция выравнивания в амино позволяет избежать ошибок вставки пробелов в границах кодонов. Translate to amino when aligning Транслировать в амины в процессе выравнивания Translation table: Таблица трансляций: Region to align Выравнивать - - Whole alignment Целые последовательности Column range Указанный регион столбцов Do not re-arrange sequences (-stable) Сохранять порядок последовательностей (ключ -stable) QObject Region should be set as 'start..end', start should be less than end, e.g. '1..100' Region should be set as 'start..end', start should be less than end, e.g. '1..100' U2::LocalWorkflow::MusclePrompter from %1 из %1 Aligns each MSA supplied %1 with MUSCLE using "%2" mode. Для каждого выравнивания%1, запустить MUSCLE в "%2" и выдать результат на выход. U2::LocalWorkflow::MuscleWorker Input MSA Входное выравнивание Multiple sequence alignment Множественное выравнивание Mode Конфигурация Stable order Сохранять порядок Multiple sequence alignment to be processed. Входные данные для выравнивания. Result of alignment. Результат выравнивания. Max iterations Максимальное число итераций Maximum number of iterations. Максимальное число итераций. An empty MSA '%1' has been supplied to MUSCLE. An empty MSA '%1' has been supplied to MUSCLE. Region to align Выравнивать Whole alignment or column range e.g. 1..100. Все выравнивание или регион, например 1..100. Align with MUSCLE Выравнивание с помощью MUSCLE MUSCLE is public domain multiple alignment software for protein and nucleotide sequences.<dfn>MUSCLE stands for MUltiple Sequence Comparison by Log-Expectation.</dfn> <dfn>Пакет MUSCLE предназначен для выравнивания множественных протеиновых и нуклеотидных последовательностей.</dfn> Region end position should be greater than start position Конец региона должен быть больше чем его начало Aligned %1 with MUSCLE Выровнял %1 с MUSCLE Selector of preset configurations, that give you the choice of optimizing accuracy, speed, or some compromise between the two. The default favors accuracy. Выбор между режимами максимальной точности, скорости либо компромиса между ними. По умолчанию оптимизируется точность выравнивания. Do not rearrange aligned sequences (-stable switch of MUSCLE). Otherwise, MUSCLE re-arranges sequences so that similar sequences are adjacent in the output file. This makes the alignment easier to evaluate by eye. Сохранять начальный порядок последовательностей в выравнивании. Иначе, MUSCLE группирует похожие последовательности в выходном выравнивании, для удобства визуального сравнения. U2::LocalWorkflow::ProfileToProfileTask Align profile to profile with MUSCLE U2::LocalWorkflow::ProfileToProfileWorker Aligned profile to profile with MUSCLE Выравнивание профиля на профиль при помощи MUSCLE Master profile Основной профиль The main alignment which will be aligned on. Основное выравнивание на которое будет произведено выравнивание. Second profile Второй профиль Alignment which will be aligned to the master alignment. Выравнивание, которое будет выровнено на основной выравнивание. Align Profile to Profile With MUSCLE Выравнивание профиля на профиль при помощи MUSCLE Aligns second profile to master profile with MUSCLE aligner. Выравнивает второй профиль на основной профиль при помощи MUSCLE. U2::MuscleAdapter No sequences in input file Выравнивание не содержит данных Internal MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка MUSCLE: %1 Undefined internal MUSCLE error Undefined internal MUSCLE error Alignment is empty Выравнивание не содержит данных Invalid input alignment Некорректное входное выравнивание Incompatible alphabets Несовместимые алфавиты Aligning profiles Выравнивание Building output Подготовка результата Aligning sequence %1 of %2 Выравнивается последовательность %1 из %2 Merging results: %1 of %2 Объединяются результаты: %1 из %2 Not enough memory to do this alignment. You can try the 64-bit version of UGENE. In this case, more available memory will be used for aligning. Недостаточно памяти для выравнивания. Вы можете попробовать 64-битную версию UGENE. Not enough memory to do this alignment. Недостаточно памяти для выравнивания. Unsupported alphabet: %1 Неподходящий алфавит: %1 U2::MuscleAddSequencesToProfileTask MUSCLE align profiles '%1' vs '%2' MUSCLE выравнивает '%1' к '%2' MUSCLE align '%2' by profile '%1' MUSCLE добавляет '%2' к '%1' A problem occurred during aligning profile to profile with MUSCLE. The original alignment is no more available. Sequences in file have different alphabets %1 Последовательности в файле имеют разные алфавиты: %1 No sequences found in file %1 Файл не содержит последовательностей: %1 No alignment found in file %1 Файл не содержит выравниваний: %1 U2::MuscleAlignDialogController Error Ошибка Illegal alignment region Неправильный регион Align Выровнять Cancel Отменить MUSCLE default По умолчанию The default settings are designed to give the best accuracy Наилучшая точность выравнивания Command line: muscle <no-parameters> Командная строка: muscle <no-parameters> Large alignment Большие выравнивания If you have a large number of sequences (a few thousand), or they are very long, then the default settings may be too slow for practical use. A good compromise between speed and accuracy is to run just the first two iterations of the algorithm При наличии тысяч последовательностей либо их большой длине, конфигурация по умолчанию может оказаться неприемлемо медленной. Хороший компромисс между скоростью и точностью обеспечивается при прогоне только первых 2-х итераций алгоритма Command line: muscle -maxiters 2 Командная строка: muscle -maxiters 2 Refine only Только улучшить Improves existing alignment without complete realignment Улучшение существующего выравнивания Command line: muscle -refine Командная строка: muscle -refine U2::MuscleAlignWithExtFileSpecifyDialogController Align Выровнять Cancel Отменить Open an alignment file Открыть выравнивание Save an multiple alignment file Сохранить множественное выравнивание Error Ошибка Illegal alignment region Неправильный регион Kalign with Align Выравнивание с помощью Kalign Input file is not set! Входной файл не указан! Output file is not set! Выходной файл не указан! U2::MuscleGObjectRunFromSchemaTask Workflow wrapper '%1' Workflow wrapper '%1' MUSCLE align '%1' MUSCLE выравнивает '%1' MUSCLE refine '%1' MUSCLE улучшает '%1' U2::MuscleGObjectTask MUSCLE align '%1' MUSCLE выравнивает '%1' MUSCLE refine '%1' MUSCLE улучшает '%1' MUSCLE add to profile '%1' MUSCLE добавляет в выравнивание '%1' MUSCLE align profiles MUSCLE выравнивает пару выравниваний MultipleSequenceAlignment object has been changed MAlignment object has been changed Объект множественного выравнивания был изменен U2::MuscleMSAEditorContext Align with MUSCLE... Выравнивание с помощью MUSCLE... Align sequences to profile with MUSCLE... Выровнять последовательности на профиль при помощи MUSCLE... Align profile to profile with MUSCLE... Выровнять профиль на профиль при помощи MUSCLE... Select file with sequences Выбор файла последовательностей Select file with alignment Выбор файла выравнивания U2::MuscleParallelTask MuscleParallelTask MuscleParallelTask There is not enough memory to align these sequences with MUSCLE. U2::MusclePlugin MUSCLE MUSCLE A port of MUSCLE package for multiple sequence alignment. Check http://www.drive5.com/muscle/ for the original version Порт пакета MUSCLE для выравнивания множественных последовательностей. Сайт оригинального пакета http://www.drive5.com/muscle/ Align with MUSCLE... Выравнивание с помощью MUSCLE... U2::MusclePrepareTask Preparing MUSCLE alignment... Preparing MUSCLE alignment... Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 MUSCLE prepared successfully MUSCLE prepared successfully No sequences in input file Выравнивание не содержит данных Alignment is empty Выравнивание не содержит данных U2::MuscleTask MUSCLE alignment Выравнивание с помощью MUSCLE MUSCLE alignment started MUSCLE alignment started Incorrect region to align Incorrect region to align Stopping MUSCLE task, because of error in MultipleSequenceAlignment::mid function Stopping MUSCLE task, because of error in MAlignment::mid function Stopping MUSCLE task, because of error in MAlignment::mid function Performing MUSCLE alignment... Performing MUSCLE alignment... MUSCLE alignment successfully finished MUSCLE alignment successfully finished Unexpected number of rows in the result multiple alignment! Unexpected number of rows in the result multiple alignment! U2::ProgressiveAlignTask ProgressiveAlignTask ProgressiveAlignTask Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 alignment "%1" Parallel MUSCLE Iter 1 accomplished. Time elapsed %2 ms alignment "%1" Parallel MUSCLE Iter 1 accomplished. Time elapsed %2 ms U2::ProgressiveAlignWorker ProgressiveAlignWorker ProgressiveAlignWorker Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 U2::RefineTask RefineTask RefineTask Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 Can't allocate enough memory to perform aligning, try to use 64bit UGENE version U2::RefineTreeTask RefineTreeTask RefineTreeTask Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 U2::RefineWorker Internal parallel MUSCLE error: %1 Внутренняя ошибка: %1 Can't allocate enough memory to perform aligning, try to use 64bit UGENE version